2026年中小企業補助款稅務處理全攻略：SBIR、SIIR補助款要繳稅嗎？
什麼是政府補助款？我的公司收到 SBIR/SIIR 補助需要繳稅嗎？
對於許多力求創新與成長的中小企業而言，政府補助款是推動研發、升級轉型不可或缺的及時雨。從最廣為人知的經濟部小型企業創新研發計畫（SBIR）、服務業創新研發計畫（SIIR），到產業升級創新平台輔導計畫（CITD），這些補助資源為企業注入了強大的動能。然而，一個最關鍵也最常被忽略的問題是：這筆從天而降的補助款，需要繳稅嗎？
答案是肯定的。根據台灣所得稅法第24條的規定，營利事業的所得計算，是以其本年度總收入減除各項成本費用、損失及稅捐後之純益額為所得額。除非有特別的法律條文明訂免稅，否則，營利事業收到的政府補助款，原則上都應視為收入的一部分，必須納入當年度的營利事業所得額中，依法課徵營所稅。因此，當您的公司成功申請到 SBIR 或 SIIR 等補助時，務必記得這筆款項會對公司的稅務產生影響。
營業稅 vs. 營所稅：政府補助款的兩大稅務關卡
收到政府補助款後，企業主必須釐清兩個主要的稅務層面：營業稅與營利事業所得稅（營所稅）。這兩者的判斷標準與處理方式截然不同，千萬不可混為一談。
營業稅申報：我的補助款需要開立統一發票嗎？
關於營業稅，關鍵在於判斷該補助款是否為「銷售貨物或提供勞務的代價」。
- 需要開立發票的情境：如果政府補助的性質，是作為貴公司提供特定商品或服務給政府機關或第三方消費者的報酬，那麼這筆補助款就具有「對價關係」，應視為銷售額的一部分，必須開立統一發票並報繳5%的營業稅。例如，政府為推廣電動車，補助民眾購車款，車商收到的這筆差額補助款，就屬於銷售貨物取得的代價。
- 免開立發票的情境：相對地，如果補助款純粹是為了獎勵或資助企業的特定政策目標（如研發創新、投資特定設備），與公司銷售的商品或服務沒有直接對價關係，則無須開立統一發票，也免徵營業稅。絕大多數的研發性質補助，如 SBIR、SIIR、CITD，都屬於此類。
簡單來說，請詳閱您的補助計畫合約，確認是否有要求您因這筆補助而需交付特定產出給政府。若無，通常就不涉及營業稅問題。
營所稅申報：補助款應列為哪一年的收入？
在營所稅方面，台灣稅法採行「權責發生制」（Accrual Basis）。這意味著收入的認列時間點，是以權利義務確定的日期為準，而非實際收到現金的日期。因此，政府補助款應在計畫核准、公司確定能收到該筆款項的年度，就全額認列為「其他收入」，而非等到款項入帳才認列。
政府補助款的會計實務：帳務處理步驟化教學
正確的會計處理是稅務申報的基礎。以下我們將常見情況分為三種，提供中小企業主或會計人員清晰的實作指引。
步驟一：收到補助款的會計分錄
當補助款核准撥入公司帳戶時，最基本的會計分錄如下：
借：銀行存款 XXX,XXX
貸：其他收入－政府補助款 XXX,XXX借：銀行存款 XXX,XXX
貸：其他收入－政府補助款 XXX,XXX這個分錄直接將補助款認列為當期收入。這是最單純的處理方式，適用於補助款主要用於補貼人事、行銷等費用性支出的情況。
步驟二：購置資產的會計處理
若補助款是用於購置機器設備、軟體等「固定資產」，處理方式則有所不同。為了符合收入與費用配合原則，會計上建議將補助款收入與資產的折舊費用在同一期間內分期認列。
處理方式：收到補助款時，先將其列為「遞延收入」（負債科目）。然後，配合該資產的折舊年限，每年將部分遞延收入轉為當期收入。例如，一台補助款購置的機器設備耐用年限為5年，則每年認列1/5的補助款收入。
| 處理方式 | 優點 | 缺點 | 適用情境 |
|---|---|---|---|
| 一次性認列收入 | 帳務處理簡單 | 收到補助款當年度稅負較重 | 補助款用於費用支出 |
| 分期攤銷認列收入 | 稅負平均分攤，符合收入費用配合原則 | 帳務處理較複雜，需逐年追蹤 | 補助款用於購置固定資產 |
步驟三：用於費用支出的會計處理
如果補助款是用於支付研發人員薪資、原料費、委外測試費等「費用性支出」，處理相對單純。相關費用在發生時，應正常認列為公司的營業費用；而補助款收入則在核准年度一次性認列為「其他收入」。這樣，增加的收入與增加的費用便能在同一個財報年度中互相匹配。
SBIR/SIIR/CITD 三大補助計畫稅務處理比較
雖然稅務大原則相同，但不同補助計畫的特性仍會影響會計處理的細節。我們整理了台灣最常見的三大中小企業補助計畫，幫助您快速掌握重點。
| 計畫名稱 | 主要目的 | 營業稅處理建議 | 營所稅處理建議 | 會計處理重點 |
|---|---|---|---|---|
| SBIR | 鼓勵中小企業投入創新技術或產品研發 | 免開立發票 | 應稅，列為其他收入 | 若用於購置研發設備，建議採分期認列收入；若用於人事等費用，可一次性認列。想知道如何運用 AI 快速產出高品質的 SBIR 計畫書嗎？試試我們的SBIR 計畫書 AI 撰寫工具。 |
| SIIR | 鼓勵商業服務業發展創新服務模式 | 免開立發票 | 應稅，列為其他收入 | 與 SBIR 類似，根據補助款的實際用途（購置資產或支付費用）來決定收入認列方式。 |
| CITD | 協助傳統產業進行技術開發、產品創新 | 免開立發票 | 應稅，列為其他收入 | 同上，依資金用途進行帳務處理，並確保計畫核銷的支出項目與公司帳冊一致。 |
避免常見錯誤：政府補助款稅務申報的注意事項
為了避免未來被國稅局查核補稅甚至罰款的風險，請務必留意以下幾點：
- 切勿漏報收入：這是最嚴重也最常見的錯誤。務必記得將補助款核准金額全數列入當年度的非營業收入（其他收入）中。
- 釐清免稅範圍：不要誤以為免繳營業稅就等於免繳營所稅。兩者是完全獨立的稅目，判斷標準不同。
- 確保帳務一致：提交給政府的計畫核銷單據，其項目與金額必須與公司內部的會計帳冊完全一致，不可有兩套帳。
- 正確攤提收入：若補助款用於購置資產，務必依規定將收入與資產折舊同步攤提，避免在首年度虛增過多利潤。
如果您不確定自己的公司適用哪種補助，或想了解完整的申請流程，歡迎參考我們的政府補助指南，或使用補助試算工具評估您的資格。
結論：善用政府補助，穩健處理稅務，加速企業成長
政府補助是企業發展的加速器，但伴隨而來的稅務責任也不容忽視。總結來說，企業主應建立正確觀念：大部分政府補助款都需繳納營所稅，並應在核准年度認列收入。至於是否需繳納營業稅，則視補助款是否為銷售商品或服務的對價而定。透過清晰的會計處理與正確的稅務申報，不僅能確保公司營運的合規性，更能讓您無後顧之憂地善用補助資源，專注於核心業務的創新與成長。
若您在補助款的帳務處理或稅務申報上遇到複雜問題，或需要專業的計畫書撰寫協助，智研所團隊隨時準備好為您服務。歡迎聯絡我們，讓我們的專家成為您企業成長路上的最佳夥伴。
FAQ 常見問題
Q1: 我的公司是採用書審方式報稅，收到補助款會有影響嗎？
A: 會有影響。採用書審（擴大書面審核）報稅的公司，雖然稅務計算相對簡便，但補助款仍應列為「非營業收入」。這筆收入會直接增加您的全年營業收入淨額，並依書審純益率計算課稅所得額。若漏報，國稅局仍可能根據資料要求補稅。
Q2: 如果補助款計畫沒執行完，或被政府要求繳回部分款項，稅務上該如何處理？
A: 如果發生計畫中止或需繳回款項的情況，應在事實發生的年度，將繳回的金額列為「其他損失」。例如，您在2026年認列了100萬補助收入，但在2027年因故繳回20萬，那就在2027年的財報中認列20萬的「其他損失」，用以沖銷前一年度的收入。
Q3: 申請政府補助，除了稅務外還要注意什麼？
A: 除了稅務合規，更重要的是計畫的執行與核銷。您必須確保所有支出都符合計畫書規範，並保留所有相關單據（如發票、合約、薪資紀錄）。計畫的執行進度、報告繳交、以及最終的成果展現，都是確保補助案順利結案的關鍵。更多相關問題，可以參考我們的常見問題頁面。
